Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL512326.1-201ENST00000443050 721 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC091167.1-201ENST00000492017 396 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AL355096.1-201ENST00000553561 447 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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RPE65Q16518 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
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RPE65Q16518 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 SLC17A3-204ENST00000397060 2052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.73
RPE65Q16518 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
RPE65Q16518 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC4.21□□□□□ -1.74
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