Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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SEC23BQ15437 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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SEC23BQ15437 LINC00364-201ENST00000415120 611 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SEC23BQ15437 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
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