Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 TAF1A-AS1-202ENST00000427540 750 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CNGB1Q14028 RNU6-413P-201ENST00000384115 107 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms