Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 OR56A3-203ENST00000641160 4438 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC023469.2-201ENST00000425983 657 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 GPC6-AS2-201ENST00000445540 587 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RPS3A-204ENST00000506126 862 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MRPL51-207ENST00000543959 472 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC015726.1-201ENST00000602353 681 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 PTPN22-207ENST00000528414 3424 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HMGB3P22-202ENST00000451823 572 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 ZBTB20-AS3-201ENST00000498630 464 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL356215.1-201ENST00000528366 1102 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
PRPF4BQ13523 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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