Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 OR6C4-201ENST00000394256 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MIR423-201ENST00000362201 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 C1GALT1C1L-201ENST00000475092 1172 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
SRSF5Q13243 RPS4XP13-201ENST00000483219 789 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms