Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC010186.3-201ENST00000537616 2508 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNY4P37-201ENST00000516225 96 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 FANCI-202ENST00000310775 4743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 TIMM9P2-201ENST00000419324 266 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 COX7BP2-201ENST00000437976 242 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
CHAF1BQ13112 ACTR3BP4-201ENST00000503033 1244 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
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