Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 RAC1P3-201ENST00000416129 580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC02032-201ENST00000490465 391 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC018616.1-201ENST00000524085 546 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC019278.1-201ENST00000623516 479 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 KCNT2-202ENST00000367433 5883 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 DTNA-208ENST00000554864 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 LINC00971-202ENST00000484892 7308 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CHAF1AQ13111 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms