Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF682-208ENST00000596019 552 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NADK2-211ENST00000617628 744 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 GNRHR-201ENST00000226413 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 MIER3-205ENST00000409421 2152 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 VN1R1-201ENST00000321039 2353 ntAPPRIS P1 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 CDH18-205ENST00000506372 2432 ntTSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.16
MKRN3Q13064 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 WNK3-201ENST00000354646 11341 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC244100.2-202ENST00000612584 3878 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MORC3-201ENST00000400485 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 INTS4-209ENST00000534064 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AKAP5-202ENST00000394718 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN3Q13064 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN3Q13064 AL139220.2-214ENST00000437643 614 ntTSL 3 BASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN3Q13064 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
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MKRN3Q13064 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 TP63-207ENST00000418709 2810 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.77□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 PTPRR-202ENST00000342084 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 TTC26-203ENST00000464848 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 IL1RAP-201ENST00000072516 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.76□□□□□ -1.17
MKRN3Q13064 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC7.76□□□□□ -1.17
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