Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SUPT3H-202ENST00000371459 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 STATH-202ENST00000381060 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL445528.1-201ENST00000426330 420 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC026412.2-201ENST00000512270 1075 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SETP4-201ENST00000455717 868 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC063919.1-201ENST00000514281 254 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 ADCY10-202ENST00000367851 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 PIK3C2G-202ENST00000433979 4840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
PTPN13Q12923 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
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