Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC012181.3-201ENST00000565861 601 ntTSL 4 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC009229.4-201ENST00000623854 1947 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 DARS-AS1-206ENST00000446492 488 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC087477.3-201ENST00000559214 552 ntTSL 4 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AC233309.1-201ENST00000619522 751 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
LMOD1P29536 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 C15orf41-201ENST00000338183 2578 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 OR10A6-204ENST00000642108 6104 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
LMOD1P29536 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.9 ms