Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL590378.1-201ENST00000426818 303 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC117513.1-201ENST00000462792 766 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NELL2-211ENST00000548826 559 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 THRB-203ENST00000396671 7506 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AP000146.1-203ENST00000444178 309 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC006427.1-201ENST00000514359 712 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ZNF224-201ENST00000336976 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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