Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC091685.2-201ENST00000454924 864 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 GAPDHP62-201ENST00000515313 990 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 FRK-201ENST00000606080 13230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ZNF766-201ENST00000439461 6298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 YTHDC1-207ENST00000579690 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC092017.2-201ENST00000427600 362 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CEACAMP7-201ENST00000444105 496 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 HMGB1P4-201ENST00000455362 567 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TCF4-284ENST00000637169 7553 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF420-202ENST00000337995 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 WAC-209ENST00000428935 1320 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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