Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MTND4P18-201ENST00000447010 465 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC069306.1-201ENST00000507006 843 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 HMGB3P26-201ENST00000560051 582 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC087894.1-201ENST00000538359 518 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC011492.1-201ENST00000600023 315 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AL353706.1-201ENST00000436728 494 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
ERVV-2B6SEH9 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms