Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092079.1-201ENST00000558620 1985 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CASP12-210ENST00000494737 961 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 L34079.2-201ENST00000597119 561 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC133644.2-201ENST00000608142 540 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RNU1-94P-201ENST00000362627 173 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL078604.1-201ENST00000404609 466 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 YWHAZP8-201ENST00000436935 731 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 PRPF38AP2-201ENST00000438179 851 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
EHD3Q9NZN3 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
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