Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC113385.1-201ENST00000511468 563 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 EMB-205ENST00000514111 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL133372.1-201ENST00000493565 745 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR5H3P-201ENST00000502817 919 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC010445.1-201ENST00000507674 440 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms