Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC245128.3-201ENST00000594721 748 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
IMPG1Q17R60 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms