Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC104115.2-201ENST00000523026 687 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC007685.1-201ENST00000329806 452 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 TUBD1-204ENST00000376094 1154 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL355303.1-201ENST00000428920 680 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CDKN3Q16667 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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