Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AP000827.1-201ENST00000527814 258 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC011477.5-201ENST00000586571 259 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 VIP-202ENST00000367244 1584 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 HGF-201ENST00000222390 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC074029.1-201ENST00000552531 1044 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC005771.1-201ENST00000585581 349 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.58
FSCN1Q16658 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 ARL4AP5-201ENST00000404372 599 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 RPL37P21-201ENST00000435890 276 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 PDSS1P2-201ENST00000449397 678 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 SNRPFP4-201ENST00000456366 242 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
FSCN1Q16658 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms