Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 OR8R1P-201ENST00000543943 764 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 TTN-AS1-222ENST00000587576 399 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 MEG8-222ENST00000637332 1237 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 AC104389.1-201ENST00000418080 522 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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PDK4Q16654 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 TMEM87A-212ENST00000568432 750 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 SUGT1-201ENST00000310528 14131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PDK4Q16654 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
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