Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 C1DP1-201ENST00000426049 402 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPS4XP4-201ENST00000443195 763 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU6-276P-201ENST00000516114 96 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC092364.1-201ENST00000598561 471 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR1S1-201ENST00000624470 978 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TRDN-206ENST00000628709 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 FAM208A-202ENST00000431842 7119 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ZNF700-202ENST00000482090 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SYT14-208ENST00000637265 13567 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SNORD65.1-201ENST00000390889 71 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SGCBQ16585 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 155.7 ms