Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 VNN2-206ENST00000525270 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TMLHE-AS1-201ENST00000433624 1702 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL645927.1-201ENST00000396783 406 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL035404.2-201ENST00000424418 304 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL096678.1-201ENST00000438877 472 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC117465.1-201ENST00000457125 522 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RMDN2-201ENST00000234195 1985 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FOXN2-203ENST00000616844 1414 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ZNF248-201ENST00000357328 4795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 HECTD4-211ENST00000550722 15450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SH3YL1-203ENST00000403657 3540 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL590666.1-201ENST00000428641 433 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR5M2P-201ENST00000529003 936 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
GRIK4Q16099 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.1 ms