Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC106734.1-201ENST00000568646 663 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AC091905.4-201ENST00000623432 202 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
VAMP3Q15836 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 PGGT1B-203ENST00000419445 9545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC018467.1-203ENST00000440785 506 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC01004-201ENST00000445184 686 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RN7SKP147-201ENST00000517154 244 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC015522.1-201ENST00000523678 640 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 TAS2R8-201ENST00000240615 1243 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR4K15-201ENST00000305051 1216 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
VAMP3Q15836 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
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