Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RGS5-218ENST00000526176 574 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC112694.2-201ENST00000623697 768 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 NLGN1-206ENST00000457714 8242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 GSTA7P-201ENST00000438425 448 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 LINC01481-201ENST00000552998 629 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 BBIP1P1-201ENST00000602999 279 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
BRD3Q15059 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.7 ms