Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 MIR6875-201ENST00000617506 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC097717.1-228ENST00000417006 754 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC01850-201ENST00000429916 357 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPL21P131-201ENST00000497298 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR6830-201ENST00000636015 70 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LIG4-203ENST00000442234 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR2B2-201ENST00000303324 1212 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TRAPPC2P4-201ENST00000421750 331 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 AC107068.2-201ENST00000634611 447 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR1S2-202ENST00000641683 941 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
SMCO1Q147U7 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MKLN1-204ENST00000429546 572 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
SMCO1Q147U7 AC109635.4-202ENST00000531666 412 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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