Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 GJE1-201ENST00000450456 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL451086.1-201ENST00000605596 223 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ANKRD20A10P-201ENST00000457591 1515 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.19□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SAMSN1-202ENST00000400564 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 IQCG-204ENST00000453254 1230 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RPS6P4-201ENST00000494693 758 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RN7SKP157-201ENST00000516174 282 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNA5SP108-201ENST00000605921 117 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 BOLA3P4-201ENST00000418151 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
ALCAMQ13740 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
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