Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 USP9YP5-201ENST00000511770 630 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC087373.1-201ENST00000524920 491 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 DAZAP2-209ENST00000549732 601 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 NBEAP1-201ENST00000554452 979 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MTCO1P40-201ENST00000574371 625 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC244505.7-201ENST00000599675 272 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LLPH-201ENST00000266604 7746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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TRAF1Q13077 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AP003392.5-201ENST00000607857 415 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC007671.2-201ENST00000637344 619 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 ZFYVE16-201ENST00000338008 6773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
TRAF1Q13077 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
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