Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.69
FOXD4Q12950 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AMD1P2-201ENST00000412936 992 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 NRBF2P2-201ENST00000413087 861 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ALG13-211ENST00000473389 693 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 KCNJ16-201ENST00000283936 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SNORD96B-201ENST00000386148 79 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL451140.1-201ENST00000430534 371 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 MTCO2P20-201ENST00000437339 673 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC007327.1-201ENST00000447461 264 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
FOXD4Q12950 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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