Protein–RNA interactions for Protein: P60709

ACTB, Actin, cytoplasmic 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTBP60709 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
ACTBP60709 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL356806.1-201ENST00000422524 916 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 KCTD10P1-201ENST00000434203 625 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL360091.1-201ENST00000447949 496 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 NCRNA00250-201ENST00000519500 519 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SLC14A2-AS1-203ENST00000592286 528 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
ACTBP60709 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 DNASE2B-202ENST00000370665 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
ACTBP60709 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
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