Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CENPFP49454 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 TAS2R30-201ENST00000539585 1687 ntAPPRIS P1 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 DDX18P3-201ENST00000404856 2007 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CENPFP49454 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 MYOT-202ENST00000421631 1474 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 NCAM2-201ENST00000284894 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC084024.3-201ENST00000520598 562 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CENPFP49454 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 SLCO1C1-208ENST00000545102 2868 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CENPFP49454 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 MIR4727-201ENST00000622232 55 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CENPFP49454 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CENPFP49454 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CENPFP49454 MTCO3P16-201ENST00000454456 754 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms