Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC011939.2-201ENST00000567396 428 ntTSL 3 BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 AP001521.2-201ENST00000608772 546 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 SLC4A4-202ENST00000340595 7640 ntTSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.08□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.07□□□□□ -1.44
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PTPRAP18433 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC6.07□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
PTPRAP18433 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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