Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AP004607.2-201ENST00000533949 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SOAT1-201ENST00000367619 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PTPN3-202ENST00000374541 6703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TTC6-202ENST00000382320 1972 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TBC1D5-201ENST00000253692 7854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 OSGEPL1-201ENST00000264151 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD8P13378 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
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