Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 BMPR1B-203ENST00000440890 5388 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 GLCE-202ENST00000559420 4840 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 GCA-203ENST00000429691 824 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC006499.5-201ENST00000505037 514 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPRCP08575 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPRCP08575 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPRCP08575 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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PTPRCP08575 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRCP08575 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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PTPRCP08575 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC104108.1-201ENST00000509930 412 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC068408.2-201ENST00000584566 439 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
PTPRCP08575 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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