Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC007823.1-201ENST00000569932 1566 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL356967.1-201ENST00000406305 431 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 OR2B8P-201ENST00000432841 938 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC092170.1-201ENST00000440211 356 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 ANKRD30BP3-201ENST00000444850 1070 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 AC010881.1-201ENST00000433830 235 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
VAX2Q9UIW0 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.7 ms