Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SLC35A5-206ENST00000492406 4399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 BBX-201ENST00000325805 3517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 ADGRL3-210ENST00000508946 4758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 OR1Q1-201ENST00000297913 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 OR2M4-201ENST00000306687 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27AP18-201ENST00000515536 459 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU7-51P-201ENST00000516560 62 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL208P-201ENST00000577964 296 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF711-202ENST00000360700 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MGAT4A-203ENST00000409391 2018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PCDH15-205ENST00000373957 7032 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 VCAN-201ENST00000265077 12625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AMY2A-204ENST00000622339 1862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-2-201ENST00000365668 141 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 PRELID1P1-201ENST00000403549 660 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL359092.1-201ENST00000417156 265 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
TIMMDC1Q9NPL8 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
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