Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CXXC1P1-203ENST00000589302 746 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL079305.1-201ENST00000623159 3008 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC023347.2-201ENST00000433994 462 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC006994.1-201ENST00000438212 839 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL035701.1-201ENST00000444038 462 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC008505.1-205ENST00000637847 703 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MBNL3-205ENST00000370857 8760 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RPL36AP36-201ENST00000418616 301 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
RTL8BQ17RB0 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms