Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PHBP17-201ENST00000528576 541 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BNIP3P22-201ENST00000593399 556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MYBPC1-214ENST00000549145 4031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BANK1-206ENST00000504592 3544 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CLIP1-AS1-201ENST00000535976 1745 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LMO3-225ENST00000541295 3498 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RAPH1-207ENST00000423104 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CRISP3-203ENST00000371159 872 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 TRAV21-201ENST00000390449 343 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR4K12P-201ENST00000406538 961 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPL10P17-201ENST00000453852 316 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 HAX1-208ENST00000483970 1151 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SCARNA16.4-201ENST00000516956 187 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC022360.2-202ENST00000517308 407 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC091534.1-202ENST00000549953 468 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC007424.1-203ENST00000554613 687 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 RN7SL802P-201ENST00000577858 299 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
CCDC85BQ15834 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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