Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SNRPE-201ENST00000367208 355 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL391839.1-201ENST00000417447 265 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC078993.1-203ENST00000435789 1037 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNU6-488P-201ENST00000515918 99 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC087341.1-201ENST00000521490 491 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC011824.2-203ENST00000579975 633 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC006133.1-201ENST00000617106 264 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 LIPI-201ENST00000344577 1652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
CDH18Q13634 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
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CDH18Q13634 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
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CDH18Q13634 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL020997.3-201ENST00000602843 359 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
CDH18Q13634 AL445435.1-201ENST00000604232 665 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
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