Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PIK3CB-214ENST00000544716 3181 ntTSL 1 (best) BASIC7.04□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPL31P54-201ENST00000429803 370 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC092757.1-201ENST00000467293 467 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OPRM1-223ENST00000524163 1251 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL352979.3-201ENST00000553515 247 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC010928.3-201ENST00000587712 541 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC130352.1-201ENST00000602979 661 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 AC006840.1-201ENST00000623069 542 ntBASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC7.03□□□□□ -1.28
NEUROD1Q13562 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.03□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.1 ms