Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC003075.1-202ENST00000419382 720 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TPTE2P3-201ENST00000441562 1189 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ST6GAL2-IT1-201ENST00000446058 388 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LRRC37A5P-202ENST00000536054 1095 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC009396.3-201ENST00000555680 354 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 VEPH1-203ENST00000392833 3979 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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PRPF4BQ13523 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNF38-210ENST00000611646 5185 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
PRPF4BQ13523 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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