Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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TCOF1Q13428 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
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TCOF1Q13428 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TCOF1Q13428 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TCOF1Q13428 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TCOF1Q13428 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TCOF1Q13428 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TCOF1Q13428 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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TCOF1Q13428 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 LTN1-207ENST00000614971 7756 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
TCOF1Q13428 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
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