Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 TMEM212-AS1-201ENST00000449106 427 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ACTG1P13-201ENST00000486987 1043 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EPGN-204ENST00000502358 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EPGN-206ENST00000503098 339 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EPGN-207ENST00000505212 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 OR52Z1-201ENST00000510471 897 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EPGN-209ENST00000514968 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC092851.1-201ENST00000535964 478 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC090948.1-201ENST00000607464 549 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 FBXO8-205ENST00000615392 1591 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 USP26-201ENST00000370832 3642 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL160272.1-201ENST00000421509 521 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 ANK3-207ENST00000460468 677 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LINC02050-201ENST00000473938 712 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
SNTA1Q13424 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms