Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MTCO2P7-201ENST00000446518 666 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 OR6C5P-201ENST00000452388 923 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 HCG17-214ENST00000453558 732 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC01491-202ENST00000558792 439 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 BCLAF1P2-201ENST00000624956 2609 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SEMA3BQ13214 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ZNF208-207ENST00000609966 3653 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 SNRPEP3-201ENST00000338402 276 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 CYP4F29P-201ENST00000420685 446 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 LINC01857-201ENST00000429730 492 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 UBE2V1P3-201ENST00000439651 417 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 GEMIN8P3-201ENST00000445417 720 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SEMA3BQ13214 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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