Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 C1orf54-201ENST00000369098 418 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL449043.1-202ENST00000427318 582 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC087855.1-201ENST00000518178 430 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC134698.5-201ENST00000519444 336 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 TEX41-256ENST00000626411 368 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FP325313.1-201ENST00000638228 703 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 HSD17B11-201ENST00000358290 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
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FOXO1Q12778 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC012442.1-201ENST00000436885 529 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL157359.1-201ENST00000449840 424 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 BTF3P5-201ENST00000457252 467 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AL121766.1-201ENST00000547436 487 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
FOXO1Q12778 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.38□□□□□ -1.71
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