Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 TATDN1-221ENST00000630259 915 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MTCYBP31-201ENST00000438855 1122 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TTPAP49638 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 C11orf74-201ENST00000334307 863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 U3.11-201ENST00000364476 212 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 HMGB1P10-201ENST00000395823 563 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 RNA5SP44-201ENST00000410446 133 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL512641.1-201ENST00000427232 548 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
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TTPAP49638 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01455-201ENST00000503167 561 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC016550.2-202ENST00000511940 581 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TTPAP49638 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
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