Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 HSP90AA4P-202ENST00000506915 2228 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 TRIM60P3Y-201ENST00000432201 673 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL671855.1-201ENST00000446875 1203 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 PDCL2P2-201ENST00000533651 189 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 UBE2NP1-201ENST00000545592 458 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC015849.3-201ENST00000603981 488 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 FEZ2-201ENST00000305852 1782 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 ERBIN-204ENST00000380943 6410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL645931.1-201ENST00000439737 410 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL080313.2-201ENST00000456440 489 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 SUMO2P20-201ENST00000520803 283 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXD10P28358 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXD10P28358 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXD10P28358 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
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HOXD10P28358 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 IL23R-202ENST00000395227 1459 ntTSL 3 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
HOXD10P28358 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
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