Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC027309.2-201ENST00000520566 192 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
CIPCQ9C0C6 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC079915.1-201ENST00000584382 2780 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU4-91P-201ENST00000364778 135 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ESD-201ENST00000378697 1079 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 OFD1P13Y-201ENST00000431179 1232 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 PPIAP21-201ENST00000464473 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC103987.1-201ENST00000473394 348 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC090506.1-201ENST00000583089 572 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC018816.2-201ENST00000621460 353 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
CIPCQ9C0C6 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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