Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 508 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 AC015660.2-201ENST00000561362 323 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC079089.3-201ENST00000603094 673 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL590240.3-201ENST00000621416 943 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC093157.2-201ENST00000414686 671 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL138878.2-201ENST00000440581 1241 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 LINC02366-202ENST00000541949 696 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
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UBXN4Q92575 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 IL13RA2-201ENST00000243213 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
UBXN4Q92575 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
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