Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL512646.1-201ENST00000269395 1077 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SYCP3-202ENST00000392924 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 SNORA76.2-201ENST00000517095 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC084838.1-201ENST00000532973 312 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC139103.1-201ENST00000534696 1030 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 AL645937.1-201ENST00000641739 1652 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SP6Q3SY56 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TNFAIP8-203ENST00000415806 1990 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TAS2R9-201ENST00000240691 1075 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU6-796P-201ENST00000391086 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HMGB3P23-201ENST00000414981 585 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC016712.1-201ENST00000431088 378 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 BTBD7P2-201ENST00000441962 620 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 SNHG27-202ENST00000507933 491 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SP6Q3SY56 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 206.1 ms