Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 LINC02488-201ENST00000504287 652 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AP003049.1-201ENST00000529418 457 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MYRFL-202ENST00000535034 881 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC00911-201ENST00000555272 546 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MIR16-2-201ENST00000362117 81 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL606495.1-201ENST00000422100 813 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ARL4AP4-201ENST00000434170 518 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC00972-202ENST00000438065 788 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC034228.3-201ENST00000446275 562 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LINC01312-202ENST00000456347 813 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC068587.1-201ENST00000483613 781 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 PRELID3BP5-201ENST00000508612 460 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC103988.1-201ENST00000566382 2177 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 DNAH14-203ENST00000366848 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RNU2-65P-201ENST00000410162 185 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SGCAQ16586 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.8 ms