Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MRPL42P4-201ENST00000453267 443 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC010601.1-202ENST00000567304 547 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 SLC38A11-204ENST00000409662 1542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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VPS72Q15906 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
VPS72Q15906 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 PARD3B-212ENST00000613457 7559 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
VPS72Q15906 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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